沈阳农业大学生物科学技术学院生物工程专业成立于2001年，专业现有专任教职工17人，其中教授3人，副教授5人，讲师9人，其中具有博士学位13人，硕士学位4人。师资队伍具有较高的学术水平，年龄结构合理，梯队稳定。生物工程专业教师近年发表科研论文近80余篇，其中 SCI论文18篇，权威期刊22篇，中文核心80余篇。教师获得市厅级以上科研奖励共计4项，其中，省级奖励2项，市级奖励2项。主持各级科研课题共计20项。其中，国家级科研课题6项，省部级科研课题6项，市厅级科研课题4项，校级科研课题4项。
生物工程专业通过对国内知名高校生物工程专业人才培养目标，以及生物工程高级人才所需知识、能力和素质的充分调研与分析，确定了本专业人才培养的目标，即以综合素质的培养为根本，强调先进性、创新性和社会实践性，造就出具有创新精神和实践应用能力，复合型人才。新的人才培养目标既符合社会对生物工程人才的需求、遵循了生物工程学科的发展规律，又反映了学科发展的最新进展、体现了本专业的办学特色，得到了校内外专家们的一致好评。同时，针对专业特点和人才培养目标的要求，对学科基础课、专业课及选修课等课程的内容进行了优化、调整和拓展，并重点改革了理论课程的配套实践课程教学内容，引入了独立的教学实践课程。改革教学方法与教学手段，加强课程与教材建设。通过主要课程的建设，进一步理顺了各门专业课程之间的关系，使各门课程的内容能够更好地衔接，从而促进了整个课程体系的建设。改革实践教学课程内容、教学方式及考核办法，建立校内外实践教学基地。重视实践教学，培养学生的动手能力，不断改革、改进实习、课程设计等实践教学环节。通过实践课程更生动地理解了专业理论知识，培养了自己的专业技能和分析实际问题的能力，为将来的就业和实际工作积累了宝贵的经验。建立健全创新鼓励机制，鼓励学生积极参与科技创新、创业活动。通过这些活动，绝大多数学生的实践创新能力得到了大幅提升，越来越多的学生参与到辽宁省大学创新创业训练计划项目、沈阳农业大学大学生科技创新立项项目当中。
